Salto Morato é a primeira Reserva Natural da Fundação, mantida desde 1994. Ela é reconhecida como Reserva Particular do Patrimônio Natural, uma unidade de conservação particular de caráter perpétuo. O principal papel que ela exerce é a proteção à natureza, mas também contribui para a economia local, já que incentiva atividades de ecoturismo, reduz o impacto de mudanças climáticas, serve como espaço de lazer e de estudos para pesquisadores. Inclusive, duas novas espécies de peixes já foram encontradas na Reserva.